ポータルを占領するためのレゾネーターには1～8のレベルがあり、プレイヤーは自分と同じレベルまでのレゾネーターを設置可能だ。高レベルのレゾネーターを設置するほどポータルの様々な性能が高くなる。
しかし、同じプレイヤーが一つのポータルに設置できるレゾネーターは、レベル8、7が1つだけ、レベル6と5は2つまで、4～2は4つまでとなっている。
ここで注意したいのが、低レベルのレゾネーターの不足だ。ポータルへのハックで手に入るアイテムのレベルは、プレイヤーとポータルのレベルのうち低い方と同じか1～2大きいレベルがほとんどとなり、高レベルのポータルへのハックではプレイヤーよりレベルの低いレゾネーターは手に入りにくいのだ。低レベルのレゾネーターの持ち合わせがなくて8つの設置枠を埋められないと、リンクを張ることができず大量AP獲得のチャンスを逃してしまう。
ポータルのレベルはレゾネーターのレベルの合計を8で割って端数を切り捨てた数値となるため、自分が占領したポータルのレベルは自分のレベルより低くなる。敵のポータルを占領する場合は、攻撃前ではなく占領後にハックすれば、低レベルレゾネーターを集めやすいぞ。
ただし、自分のレベルが7の場合、7,6,6,5,5,4,4,4という最大レベルの構成でレゾネーターを設置すると、ポータルのレベルが5となるため、レベル4以下のレゾネーターが手に入りにくいので注意が必要だ。レベル4のレゾネーターは1回につき3つ消費するので、補充しないとすぐに足りなくなってしまう。
レベル7でレベル4以下のレゾネーターを確保したければ、敵レゾネーターを破壊している途中や自分のレゾネーターを設置する途中でハックするか、レベルの低いレゾネーターを使用してポータルのレベルを抑えるなどして、ポータルのレベルが4以下のときにハックしよう。
レベル8以上でも同様の問題はあるが、APを稼いでレベルを上げる必要性は高くないので、レゾネーターが足りない場合は他のプレイヤーのために枠を空けたままにしてしまえばいいだろう。

レベルが上がってきたら、メニューのINVENTORY画面で各レベルのレゾネーターの所持数をこまめに確認するようにしよう。

ポータルのレベルは、ポータル情報画面のポータル名の脇に表示される。